Bonjour,
Le dépôt de garantie (et non caution, la caution est la personne qui se porte garant en cas d'impayés) n'a pas vocation à se substituer au paiement du loyer. Vous pouvez donc tout à fait lancer une procédure pour loyer non payé.
Au départ du locataire, vous établirez donc un état des lieux. Si, comme vous le pensez, le logement est dégradé, sa remise en état sera bien à la charge du locataire. Peu importe le montant du dépôt de garantie, le locataire est responsable de la totalité des dégradations qu'il laisse. Si le montant des travaux, justifiés par devis ou factures, dépasse le dépôt de garantie, votre locataire devra vous verser le supplément.