Bonjour,
Ce que vous signez en recevant le solde de tout compte, c'est juste une attestation comme quoi vous l'avez bien reçu. Cela ne vous empêche en rien de le contester par la suite (pendant 6 mois) si vous vous apercevez d'un manquement.
Pour les congés payés, lorsqu'ils sont payés par une caisse, c'est elle qui les paie aussi en cas de rupture de contrat. L'employeur, lui, les paie à cette caisse, il ne vas donc pas les payer deux fois.
En revanche, il y a souvent des soucis avec la caisse du BTP pour le paiement des congés après rupture de contrat...